Um grupo de investigadores do Centro de Investigação em
Biomedicina, da Universidade do Algarve, acaba de desenvolver uma ferramenta
informática que permite o acesso e análise de grandes conjuntos de dados de
expressão genética.
Tendo os dados transcriptómicos assumido um papel
fundamental enquanto recurso de trabalho e investigação para biólogos e para
uma vasta audiência de investigadores a trabalhar em áreas como a do
envelhecimento, do desenvolvimento embrionário, da diabetes, do cancro ou até
mesmo de doenças neurodegenerativas, um dos problemas encontrados continua a
ser o do acesso e da demora na análise da informação. Ao criar a ferramenta «StemMapper»,
uma base de dados de expressão genética, o grupo de investigadores liderado por
Matthias Futschik pretende facilitar a tarefa de milhares de cientistas que,
diariamente, recolhem e analisam este tipo de dados.
Esta aplicação permite que, antes de serem disponibilizados,
os dados sejam individualmente tratados, facilitando a tarefa de pesquisa,
comparação e visualização interativa aos utilizadores. Um exemplo da pertinência
desta ferramenta é a descoberta de um conjunto de putativos novos marcadores da
linhagem dos astrócitos (células mais abundantes do sistema nervoso). A
ferramenta, que acaba de dar origem a um artigo científico publicado na revista
«Nucleic Acids Research» (NAR), da Universidade de Oxford, abre caminho para
novas abordagens e avanços na área da investigação em células estaminais e encontra-se
disponível, gratuitamente, e para uso da comunidade científica em https://stemmapper.sysbiolab.eu.
